Si occupa della diversità microbica nei diversi ecosistemi e dell'effetto che questi hanno sull'ambiente. Include lo studio dei cicli biogeochimici, della biodiversità principalmente in ecosistemi acquatici nei quali i microrganismi influenzano in modo determinante il riciclo delle sostanze.
Si occupa della caratterizzazione di organismi isolati da ambienti diversi (naturale e costruito) tramite metodi di microbiologia classica, di biologia molecolare, metagenomica, trascriptomica e di proteomica con l'applicazione della spettrometria di massa MALDI-TOF.
